Diversidade genética do vírus EPTEIN-BARR

Abstract

O vírus Epstein-Barr (EBV) é um ɣ-Herpesvírus transmitido pela saliva e que infecta assintomaticamente >90% da população adulta mundial. Entretanto, o EBV é associado etiologicamente ao desenvolvimento de linfoproliferações benignas e malignas. O EBV possui um genoma dsDNA com ~170kb e se divide em dois tipos principais com propriedades biológicas diferentes: EBV-1 e EBV-2. Os mecanismos carcinogênicos mediados pelo EBV não são compreendidos em sua totalidade, e postula-se que variantes oncogênicas virais podem atuar nesses mecanismos. A incidência dos cânceres associados ao EBV apresenta grande variação geográfica, podendo estar relacionada a fatores sociogeográficos, étnicos e genéticos, sendo importante diferenciar fatores virais restritos geograficamente daqueles associados a processos tumorigênicos específicos. Neste trabalho, caracterizamos a diversidade do EBV na população do Brasil (BR), com o intuito de entender seu papel no contexto da epidemia Sul-Americana. Foram analisadas 83 amostras EBV+, incluindo carreadores assintomáticos (CA, 54,2%) e patologias benignas e malignas (PB e PM respectivamente, 45,8%). A classificação através de assinaturas aminoacídicas da região codificante (cds), de LMP1 indicou a presença de cinco diferentes cepas, com uma prevalência de 40% Med/AG876/Daudi (Med), 39% Raji/Argentine (Raji), 6% B95-8, 6% China1/CAO e 1% China2. Análises evolutivas demonstram que 79% das amostras se agruparam em dois clados com alto suporte: 40% relacionadas à variante Med (aLRT=0.95) e 39% relacionadas à variante Raji (aLRT=0.92). De forma surpreendente, as sequências oriundas dos CA e PB agruparam-se majoritariamente (61%) no clado Med, enquanto sequências relacionadas às patologias malignas agruparam-se em sua maioria (66,7%) no clado Raji, p=0,041. Polimorfismos da LMP1 de importância oncogênica (I124L/I152L, ins15pb e del30pb) foram mais frequentes no clado Raji do que no clado Med (p<0,0001 para todos os polimorfismos). Além disso, foi observado uma frequência significativamente maior (p=0,02) de cepas tipo1/V3 com alto poder replicativo no clado Raji (p=0,02). Para colocar as novas sequências de LMP1 do EBV do BR em um contexto global, adicionamos 252 sequências do LMP1 disponíveis publicamente nas análises filogenéticas por máxima verossimilhança. As cepas brasileiras se agruparam com outras da América do Sul, caracterizando as linhagens Raji/Argentine (BR=35, Argentina (AR)=33; aLRT=1) e Med [BR=33, AR =11; aLRT=0.91] como as principais em circulação na América do Sul, reunindo 71,9% das sequências. Através de análises filogeográficas bayesianas, reconstruímos a dinâmica das migrações virais do clado Raji/Argentine, aqui redefinido como “South American”. A filogenia mostrou que a linhagem derivada de Raji circulante na América do Sul se originou através de uma introdução viral proveniente do continente Africano para o Brasil entre os séculos XVII e XIX, e que posteriormente se disseminou para outros países da região (AR e Peru) e para a Europa. Nossos resultados demonstram uma grande diversidade genética do EBV circulante no Brasil, além de apontar a existência da associação entre mutações no LMP1 presentes na variante Raji do BR com patologias malignas. O Brasil parece ter sido a origem e principal fonte de disseminação da variante Raji Sul-Americana derivada da cepa africana Raji. Em conjunto, esses dados destacam a grande diversidade genética do EBV, e a importância do monitoramento e avaliação das mutações no potencial patogênico das diferentes cepas.