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dc.contributor.advisorRenault, Ilana Zalcberg-
dc.contributor.authorCoutinho, Diego Ferreira-
dc.date.accessioned2023-01-12T18:30:51Z-
dc.date.available2023-01-12T18:30:51Z-
dc.date.issued2018-
dc.identifier.citationCOUTINHO, Diego Ferreira. Aspectos funcionais das mutações de neoplasias mieloides: um estudo de modelagem in vitro baseado em edição genética por CRISPR/Cas9. 2018. Tese (Doutorado em Oncologia) - Instituto Nacional de Câncer, Rio de Janeiro, 2018.pt_BR
dc.identifier.urihttps://ninho.inca.gov.br/jspui/handle/123456789/12292-
dc.description111 p.: il. color.pt_BR
dc.description.abstractIndivíduos normais, em sua grande maioria, idosos acima de 65 anos de idade, podem apresentar nas células do sangue periférico mutações somáticas relacionadas à etiopatogênese das malignidades mieloides. Esse fenômeno, nomeado de hematopoese clonal do idoso, está associado ao risco aumentado para o desenvolvimento de neoplasias sanguíneas, o que leva a crer que essa seja uma condição pré-leucêmica. Alguns dos genes acometidos possuem função de regulação epigenética ou atuam na edição do RNA mensageiro (splicing). Até o momento, há poucas evidências sobre o papel funcional desses marcadores na carcinogênese, o que motiva os estudos baseados em modelagem das doenças malignas do sangue, sobretudo, na era da edição genômica. Com este intuito, foi realizado no presente projeto de tese a geração e o estabelecimento de clones celulares, provindos da linhagem hematopoética K562, editados geneticamente para os alvos DNMT3A (R882H), TET2, SF3B1 (K700E) e SRSF2 (P95H). Uma linhagem estável com expressão indutível de eCas9 e EGFP foi gerada, e a partir dela, foram realizadas transfecções subsequentes com os gRNAs específicos para a edição dos genes de interesse. A presença de mutações nos marcadores epigenéticos (DNMT3A e TET2) e SRSF2 não alteraram a habilidade proliferativa, comparadas às células WT, ao passo que a mutação SF3B1 K700E reduziu o crescimento dessas células. Esses dados foram confirmados por ensaio de competição clonal in vitro e in vivo, realizados em camundongos NSG. Além de impactar na viabilidade celular, a mutação em SF3B1 atribuiu resistência ao estresse genotóxico induzido por radiação gama. O mesmo comportamento não foi observado em células SRSF2 P95H, demonstrando que o fenótipo de resistência parece ser gene-específico. Mudanças nos níveis de morte por apoptose e presença de sideroblastos em anel, figura displásica relacionada a mutações no gene SF3B1, não foram observados em clones K562 editados para o gene. Em contrapartida, células com mutações em genes do spliceossoma (SF3B1, SRSF2 e U2AF1) apresentaram expressão aumentada da citocina IL-8, confirmada por ELISA e qRT-PCR. Ensaios de co-cultura entre clones K562 SF3B1 WT e K700E em presença de IL8 e/ou IL-1a mostraram que as citocinas não interferiram na capacidade proliferativa dessas células. Esses resultados foram semelhantes aos obtidos com o co-cultivo desses clones com células estromais obtidas a partir de amostras de medula óssea de indivíduos saudáveis ou acometidos com malignidade hematológica. A presença de mutações co-ocorrentes (TET2 e SF3B1) diminuíram a habilidade proliferativa dos clones afetados, além de induzir eritropoese espontânea in vitro. Em conclusão, nossos dados sugerem que a mutação K700E no gene SF3B1 foi capaz de impactar na sobrevivência e na expressão de IL-8, citocina já contextualizada, anteriormente, com neoplasias da linhagem mielóide, em especial, as síndromes mielodisplásicas. Além disso, a geração desses modelos in vitro permitirá o melhor entendimento da relação biológica entre esses marcadores genéticos e a fisiopatologia de doenças malignas do sangue.pt_BR
dc.language.isoporpt_BR
dc.subjectHematopoesept_BR
dc.subjectHematopoiesispt_BR
dc.subjectHematopoyesispt_BR
dc.subjectProcessamento Pós-Transcricional do RNApt_BR
dc.subjectRNA Processing, Post-Transcriptionalpt_BR
dc.subjectProcesamiento Postranscripcional del ARNpt_BR
dc.subjectRepetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadaspt_BR
dc.subjectClustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeatspt_BR
dc.subjectRepeticiones Palindrómicas Cortas Agrupadas y Regularmente Espaciadaspt_BR
dc.titleAspectos funcionais das mutações de neoplasias mieloides: um estudo de modelagem in vitro baseado em edição genética por CRISPR/Cas9pt_BR
dc.TypeThesispt_BR
dc.contributor.advisorcoMonte-Mór, Bárbara da Costa Reis-
dc.contributor.memberPinto, Luis Felipe Ribeiro-
dc.contributor.memberBozza, Patrícia Torres-
dc.contributor.memberRego, Eduardo Magalhães-
dc.contributor.memberVelloso, Elvira Deolinda Rodrigues Pereira-
dc.contributor.memberCarvalho, Marcelo Alex de-
dc.contributor.memberBarboza, Luciana Pizzatti-
dc.degree.grantorINCApt_BR
dc.degree.departmentCOENSpt_BR
dc.degree.programOncologiapt_BR
dc.degree.localRio de Janeiropt_BR
dc.terms.abstractNormal subjects, most of them older than 65 years, might present somatic mutations related to myeloid malignancies in peripheral blood cells. This phenomenon is called clonal hematopoiesis of the elderly and is associated with increased risk to the development of blood cancer, suggesting this is a pre-leukemic condition. Some of the genes affected by those mutations have epigenetic role or act on the mRNA editing (splicing). So far, there is little evidence on the role of these markers in carcinogenesis, which motivates studies based on modeling of malignant blood diseases, especially in the genomic editing era. We carried out the generation and establishment of clones genetically edited for DNMT3A (R882H), TET2, SF3B1 (K700E) and SRSF2 (P95H) genes from K562 hematopoietic cell line. A stable cell lineage with inducible expression of eCas9 and EGFP was generated, and subsequent transfections were performed with the gRNAs specific for edition of the genes of interest. The presence of mutations in epigenetic markers (DNMT3A and TET2) and SRSF2 did not change the cellular proliferation compared to WT clones, whereas the SF3B1 K700E mutation reduced the growth of these cells. These data were confirmed by clonal competition assay performed in vitro and in vivo on NSG mice. In addition, the SF3B1 mutation attributed resistance to genotoxic stress gamma radiation-induced. This behavior was not observed in SRSF2 P95H cells, demonstrating this phenotype seems to be gene- specific. Changes in the levels of apoptosis and presence of ring sideroblasts, a dysplastic figure related to mutations in the SF3B1 gene, were not observed in K562 clones edited for the gene. In another hand, cells with mutations in spliceosome genes (SF3B1, SRSF2 and U2AF1) showed increased expression of IL-8, confirmed by ELISA and qRT-PCR. Co-culture assays between K562 SF3B1 WT and K700E clones in the presence of IL-8 and / or IL-1a showed those cytokines did not interfere the proliferation. These results were similar such as the co-culture of those K562 clones with stromal cells obtained from bone marrow samples from healthy or MDS patients. The presence of co-occurring mutations (TET2 and SF3B1) decreased cellular proliferation and induced spontaneous erythropoiesis in vitro. In conclusion, our data suggest that the K700E mutation in the SF3B1 gene was able to impact the survival, and expression of IL-8, a cytokine previously related to myeloid neoplasms, especially MDS. In addition, the generation of these in vitro models will contribute to a better understanding of the biological relationship between these genetic markers and the malignant blood diseases.pt_BR
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