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dc.contributor.advisorCarvalho, Marcelo Alex de-
dc.contributor.authorNepomuceno, Thales da Costa-
dc.date.accessioned2022-07-15T14:25:15Z-
dc.date.available2022-07-15T14:25:15Z-
dc.date.issued2020-
dc.identifier.citationNEPOMUCENO, Thales da Costa. Avaliação do papel de CDK9 no reparo de danos ao DNA e controle do ciclo celular. 2020. Tese (Doutorado em Oncologia) - Instituto Nacional de Câncer, Rio de Janeiro, 2020.-
dc.identifier.urihttp://sr-vmlxaph03:8080/jspui/handle/123456789/9200-
dc.description147 p.: il. color.-
dc.description.abstractA via de resposta a danos ao DNA (RDD) é composta por uma cascata coordenada de sinalizações capaz de perceber e reparar diferentes tipos de lesões no DNA. As quebras de duplas fita do DNA ativam o eixo da RDD modulado por ATM-CHK2, que é responsável pela parada do ciclo celular, possibilitando o reparo da molécula. Esse tipo de dano é resolvido majoritariamente por dois mecanismos distintos: o reparo por recombinação homóloga (Homologous Recombination - HR) e o reparo não homólogo por junção de pontas (Non-homologous End-joinning - NHEJ). As proteínas BRCA1 e 53BP1 desempenham um papel importante na RDD através do direcionamento do reparo por HR ou NHEJ, porém o mecanismo exato que modula ambas as respostas não está completamente elucidado. Anteriormente, nosso grupo identificou a cinase dependente de ciclina 9 (CDK9) como uma possível parceira de interação de BRCA1 e BARD1 (BRCA1-associated RING domain 1). CDK9 é um componente do complexo de alongamento da transcrição e sua atividade está relacionada à manutenção da integridade genômica na resposta ao estresse replicativo e no reparo por HR através do recrutamento de BRCA1 aos sítios de quebra de dupla fita. Nesse trabalho demonstramos que a formação de focos de RAD51 mediante radiação ionizante não ocorre na ausência de CDK9, porém o mesmo não é observado para 53BP1. As células deficientes para CDK9 apresentam uma maior sensibilidade à inibição de PARP. Nossos resultados sugerem que a interação entre CDK9 e BRCA1 (através da porção N-terminal de BRCA1) é dependente da formação do heterodímero BRCA1/BARD1. E que o mutante E369A de CDK9, incapaz de interagir com a região C-terminal de BRCA1, não interfere no papel de CDK9 na transcrição: preservando a capacidade de fosforilação da cauda CTD da RNA polimerase II, bem como não alterando o perfil de ativação mediante fosforilação de sua alça T. Entretanto, o mutante E369A não é capaz de reestabelecer o recrutamento de BRCA1 para os sítios de danos ao DNA. Além disso, caracterizamos CHK2 como nova parceira de interação com CDK9 através de ensaios de interação proteína-proteína valendo-se de proteínas produzidas de forma ectópica e constitutiva. As células silenciadas para CDK9 apresentarem um perfil de progressão ao longo do ciclo celular alterado mediante danos ao DNA. Entretanto, tanto a sensibilidade ao Ministério da Saúde Instituto Nacional de Câncer Coordenação de Pós-graduação vii tratamento com radiação ionizante e inibidores de PARP se mostraram fenótipos independentes de CHK2. Observamos também que os níveis de PLK1 são regulados negativamente em células interferidas para CDK9, mas não em células deficientes para CHK2, e a atividade de transativação transcricional de CDK9 parece ser menor em células deficientes para CHK2. Adicionalmente, novos parceiros de interação de CDK9 foram identificamos no contexto de danos ao DNA através de rotinas de TAP-MS. Coletivamente, nossos dados estabelecem um papel para CDK9 na RDD através do reparo por HR e pelo controle do ciclo celular, bem como sugerem uma putativa função, não relacionada ao reparo, para a interação com CHK2pt_BR
dc.language.isootherpt_BR
dc.subjectQuinase 9 Dependente de Ciclinapt_BR
dc.subjectCyclin-Dependent Kinase 9pt_BR
dc.subjectQuinasa 9 Dependiente de la Ciclinapt_BR
dc.subjectQuinase do Ponto de Checagem 2pt_BR
dc.subjectCheckpoint Kinase 2pt_BR
dc.subjectQuinasa de Punto de Control 2pt_BR
dc.subjectCiclo Celularpt_BR
dc.subjectCell Cyclept_BR
dc.subjectSobrevivência Celularpt_BR
dc.subjectCell Survivalpt_BR
dc.subjectSupervivencia Celularpt_BR
dc.titleAvaliação do papel de CDK9 no reparo de danos ao DNA e controle do ciclo celularpt_BR
dc.TypeThesispt_BR
dcterms.abstractThe DNA damage response (DDR) is a well-coordinated pathway capable of sensing and repairing different types of DNA damage. Double-strand break (DSB) lesions activate the ATM-CHK2 axis, which is responsible for the cell cycle arrest, prompting cells for DNA repair. DSBs are primarily repaired through two distinct pathways: homology-directed recombination (HR) and non-homologous end-joining (NHEJ). BRCA1 and 53BP1 play an important role in DDR by orchestrating the decision between HR and NHEJ, but the precise mechanisms regarding both pathways are not entirely understood. Previously, our group identified the putative interaction of the cyclin-dependent kinase 9 (CDK9) with BRCA1 and BARD1 (BRCA1-associated RING domain 1). CDK9 is a component of the positive transcription elongation complex and has been implicated in genome integrity maintenance in replication stress response and HR repair by modulating the BRCA1 recruitment to DSB sites. Here we show that cells lacking CDK9 failure to form RAD51, but not 53BP1, ionizing radiation-induced foci (IRIF) and exhibit an increased sensitivity to PARP inhibition. Our results indicated that CDK9/BRCA1 interaction occurs through BRCA1 N-terminal region in a BRCA1/BARD1 heterodimer formation-dependent manner. We also generated a CDK9 missense mutant (E369A) that abrogates the CDK9/BRCA1 interaction. Interestingly, E369A mutation does not impact CDK9 role in transcription: retaining the phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain (CTD) activity and in its T-loop phosphorylation; but it failed to restore the recruitment of BRCA1 to DSB sites. Moreover, we characterized CHK2 as a novel CDK9-interaction partner through ectopic and constitutive protein-protein interaction assays. Cells lacking CDK9 present an altered cell cycle progression after ionizing irradiation treatment. However, as seen for its checkpoint control profile, the sensitivity to ionizing irradiation and PARP inhibition are CHK2-independent phenotypes. We also observed that PLK1 levels are downregulated in CDK9-silenced cells only in the presence of CHK2, and CDK9 transactivation activity seems to be downregulated in cells lacking CHK2. Additionally, new CDK9 interactions in a DDR-related context were identified using a TAP-MS approach. Collectively, our data place CDK9 as an important player of the DDR through HR repair and cell cycle control and suggest a putative DDR-independent role for CHK2 interaction.-
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